История возникновения этого храма восходит к 1822 году, когда настоятель Крыпецкого монастыря игумен Серафим обратился с покорнейшим прошением к Высокопреосвященнейшему Евгению (Болховитинову), архиепископу Псковскому, Лифляндскому и Курляндскому и кавалеру, об освящении двух нижних приделов Иоанно-Богословского собора: первого — преподобного Саввы Крыпецкого, второго — преподобных Антония и Феодосия Киево-Печерских чудотворцев и мучеников Евстратия, Авксентия, Евгения, Мардария и Ореста. 28 августа того же года владыка Евгений освятил упомянутые храмы. Подписанные им антиминсы благоговейно сберегались в монастырской ризнице до закрытия монастыря в 1923 году.
После 80-летнего перерыва трудами приснопамятного архимандрита Дамаскина (Сахнюка, +2007) в 2003 году возобновились богослужения в центральном приделе нижнего подклета Иоанно-Богословского собора. Митрополит Евсевий (Саввин) благословил именовать этот храм в честь новомучеников и исповедников Российских. При игумене Савве (Комарове) в 2012 году храм был расписан и украшен фресками иконописцами Иваном и Максимом Кораблевыми. Одновременно был возобновлена традиция служения праздничного богослужения в честь пяточисленных Севастийских мучеников.
Вход в придел новомучеников и исповедников Российских осуществляется через придел преподобного Саввы Крыпецкого.
Вход в приделы преподобного Саввы Крыпецкого и новомучеников и исповедников Российских
Иконостас придела новомучеников и исповедников Российских
Резной, девянный иконостас придела новомучеников и исповедников Российских был выполнен резчиком Олегом Гладких, иконы написаны в мастерской Сергия Путиева в 2005 году. Справа на иконостасе икона Спасителя, которую дополняют пять мучеников: Евстратий, Авксентий, Евгений, Мардарий и Орест в честь которых этот храм именовался до 1918 года. Слева на иконостасе Державная икона Пресвятой Богородицы, которую дополняют припадающие в молитве к Пречистой Деве, преподобные Савва и Корнилий Крыпецкие.
В приделе новомучеников и исповедников Российских находятся следующие святыни:
Храмовая икона новомучеников и исповедников Российских
Икона новомучеников и исповедников Российских была написана в 2010 году художником Александром Сергеевичем Кузнецовым.
Икона Виленских святых Антония, Иоанна и Евстафия
с частицами мощей
Икона святых мучеников Антония, Иоанна и Евстафия с частицами их мощей, была написана в г.Санкт-Петербург, частички мощей были переданы игумену Савве в г.Вильнюс, где находится рака с честными мощами этих угодников Божиих.
Икона святой преподобномученицы великой княгини Елизаветы и святой преподобномученицы инокини Варвары с частицами мощей
Частицы мощей к иконе святым преподобномученицам великой княгине Елизавете и инокине Варваре были переданы со Святой Земли благодаря благословению архиепископа Мюнхенского Марка (Арндта).
Икона преподобного Германа Аляскинского с частицей мощей
Частица мощей к иконе преподобного Германа Аляскинского была передана митрополитом Иларионом (Капралом), главой Русской Зарубежной православной Церкви в 2013 году.
Икона мучеников Евстратия, Авксентия, Евгения, Мардария и Ореста
До 1918 года храм новомучеников и исповедников Российских именовался в честь пяточисленных мучеников Евстратия, Авксентия, Евгения, Мардария и Ореста, поэтому монастырь хранит память о святых пяточисленных мучениках. Икона была написана в мастерской Максима Кораблева в 2018 году.
Икона cвященномученика Харлампия, епископа
Магнезийского с частицей мощей
Икона cвященномученика Харлампия, епископа Магнезийского была написана в мастерской Максима Кораблева.
Икона мученика Вонифатия с частицей мощей
Икона святого мученика Трифона с частицей мощей
Икона святого мученика Трифона была также написана в мастерской Максима Кораблева.
Икона священномученика Антипы с частицей мощей
Державная икона Божией Матери
Икона Царственных страстотерпцев
Все святыни храма новомучеников и исповедников Российских
находятся в сводобном доступе для поклонения.